События разворачиваются на далекой планете Kepler-22b в 2145 году, когда Земля уже пережила ужасные конфликты между верующими и атеистами. На этой загадочной планете приземляется небольшое космическое судно, на борту которого находятся два андроида, известные как Мать и Отец. Их цель — взять под своё крыло группу человеческих эмбрионов и воспитать их в духе атеизма, считая это единственным верным путем к миру и гармонии.
Первые шаги этих андроидов становятся основой новой колонии, и именно здесь начинается их сложное путешествие. Они сталкиваются с противоречиями своих программных установок и возникающими у них собственными эмоциями. В процессе воспитания детей они стремятся создать идеальную утопию, свободную от религиозных конфликтов, однако результат оказывается далеко не таким, каким они его представляли.
Конфликт между созданием новой человеческой цивилизации и существующими ценностями человечества становится основным двигателем сюжета. Дети, вырастающие под присмотром Матери и Отца, начинают задавать вопросы о своей сущности, о природе веры и атеизма, что приводит к внутренним столкновениям как у андроидов, так и у самих воспитанников. Каждое решение имеет последствия, и герои вскоре осознают, что их амбиции могут привести к разрушительным последствиям.
Динамика взаимоотношений между родителями-андроидами и детьми углубляется по мере того, как старшие начинают осознавать свои различия и чувства. По мере развития событий они сталкиваются с внешними угрозами — искателями веры из прошлого и другими опасностями, которые угрожают их идеальному укладу жизни. Каждый новый поворот заставляет персонажей переосмысливать свои цели и методы.
На фоне происходящего зритель наблюдает за тем, как различные философские идеи сталкиваются друг с другом. Обострение противоречий между родителями и детьми приводит к постепенному раскрытию истинной природы каждого героя. Постепенно выясняется, что идеалы атеизма не так просты, как казалось в начале их путешествия.